癫痫是大脑神经元突发性异常放电，导致短暂的大脑功能障碍的一种慢性疾病。据中国最新流行病学资料显示，国内癫痫的总体患病率为0.7%，年发病率为0.0288%，1年内有发作的活动性癫痫患病率为4.6%，在中国癫痫已经成为神经科仅次于头痛的第二大常见病。
基因的新致病变异位点的发现对丰富基因突变频谱，扩展基因-疾病表型谱有重要意义。近日，银丰基因通过全外显子组测序，发现了NPRL3和RYR2基因中与癫痫相关的新位点，相关文章已经发表，让我们来一起看一下吧！
01
发表期刊：Frontiers in Genetics
影响因子：4.772
合作单位：山东大学齐鲁医院，淄博昌国医院
主题：在两个局灶性癫痫家系的患者中检测到NPRL3基因两个新的变异
摘要
NPRL3（也称为C16orf35）位于16p13.3是一个高度保守的基因，在整个发育过程中广泛表达。研究表明，NPRL3编码GTPase激活蛋白（GAP）活性的一个亚基，该亚基指向RAG复合物1（GATOR1）复合体，该复合体对mTORC1途径的氨基酸感应分支起负调节作用。众所周知，在胚胎大脑发育过程中，mTORC1信号在神经发生、突触传递和可塑性中起着关键作用，从而形成完整的大脑皮层。我们在两个局灶性癫痫家系中通过全外显子测序检测到NPRL3基因两个新的变异，分别为c.954C>A/p.Y318*（PVS1+PM2_Supporting+PP4）和c.1545-1G>C（PVS1_Moderate+PM2_Supporting+PP4）。结合生物信息学分析，预测了这两个变异的有害性，确认NPRL3基因变异是这两个家庭患病的致病机制，进一步强调了NPRL3在局灶性癫痫发生中的功能，扩展了NPRL3基因-表型谱。
02
发表期刊：Frontiers in Pediatrics
影响因子：3.569
合作单位：淄博昌国医院，湖北十堰太和医院
主题：在1例局灶性癫痫儿童中检测到RYR2基因1个新的变异
摘要
Ryanodine受体2（RYR2）编码钙通道的一种组分。据报道，RYR2变异与儿茶酚胺能多态性室性心动过速（CPVT）有关，但在癫痫病例中很少报道。我们在一例局灶性癫痫儿童中通过全外显子测序检测到RYR2基因一个新的杂合截短突变（c.12670G>T/p.Glu4224*）。Sanger测序证实，这个突变是来源于母亲。随后，通过不同的生物信息学方法，预测了该变异的有害性。先证者及其母亲的心电图显示两人均具有窦性心动过速，而非RYR2突变携带者已报道的窦性心跳过缓。结合已经报道的病例，提示RYR2变异导致的临床表型具有一定的异质性。通过本研究，我们认为RYR2是局灶性癫痫的潜在候选基因。RYR2突变可能导致癫痫和心脏异常，携带RYR2变异的癫痫患者应给予更多关注，即使他们尚未表现出心脏异常。
外显子组序列包括的22,000多个基因的180,000多个外显子，仅占人类全基因组的1%，但约有85%的疾病相关遗传突变都在这个区域，涵盖了与个体表型相关的大部分功能性变异。因此全外显子测序在发掘新基因，新位点方面有巨大的潜力。
银丰基因基于全外显子测序技术开发了针对散发样本的新基因算法和新位点的文章转化的方案，助力临床数据的科研转化。
参考文献：
1. Hu J, Gao X, Chen L, Kan Y, Du Z, Xin S, Ji W, Yu Q and Cao L (2023), Identification of two rare NPRL3 variants in two Chinese families with familial focal epilepsy with variable foci 3: NGS analysis with literature review. Front. Genet. 13:1054567. doi: 10.3389/fgene.2022.1054567
2. Hu J, Gao X, Chen L, Zhou T, Du Z, Jiang J, Wei L and Zhang Z (2022) A novel mutation in ryanodine receptor 2 (RYR2) genes at c.12670G>T associated with focal epilepsy in a 3-year-old child. Front. Pediatr. 10:1022268. doi: 10.3389/fped.2022.1022268
